O Estabelecimento Prisional de Coloane é composto pelas zonas prisionais masculina e feminina, dentro dos quais, o Bloco 9 uma zona prisional especial, que fica anexa à Escola Superior das Forças de Segurança de Macau, destina-se a reclusos submetidos à medida de prevenção de segurança e de especial isolamento.

Nas zonas prisionais, para além das celas, são estebelecidas salas de aula, oficinas, salas multi-funcionais para a aprendizagem e actividades dos reclusos, bem como, a enfermaria que fornece a assistência médica básica aos mesmos.

Para uma execução de vigilancia e prestação de assistência médica aos reclusos internados com maior eficiência, foi estabelecida no Centro Hospitalar Conde São Januário uma ala de internamento, com certos serviços de consulta externa e de internamento, serviços de turnos dos profissionais médicos e enfermeiras, sob vigilancia dos guardas prisionais.