O Instituto de Menores, dividido em Ala Masculina e Ala Feminina, com funcionamento independente, dispõe do Centro de Observação, Centro Educativo e Centro de Educação e Formação. Em cumprimento da decisão do juiz, os jovens infractores são colocados em diferentes centros, beneficiando de acompanhamento e educação nos termos da lei.

O Centro de Observação destina-se aacolher os jovens sujeitos à observação em regime de internado decidido pelos tribunais e jovens que ainda não tenham sido objecto de decisão judicial, mas para os quais seja necessária a sua colocação a títuto provisório em instituição, geralmente com duração não superior a 20 dias, excepto prorrogação, pelo período máximo de 10 dias.

O Centro Educativo tem como destinatários os jovens a quem tenha sido aplicada pela primeira vez a medida de internamento, com a duração de 1 ano e máxima de 3 anos. Os internados deste Centro são submetidos à formação para uma vida regrada, aprendizagem escolar normal, formação de habilidade e educação sob assistência.

O Centro de Educação e Formação destina-se aacolher jovens que tenham cometido crimes graves, praticado novamente factos ilícitos durane o internamento no Instituto de Menores ou após a libertação, bem como, sido colocados no Centro Educativo mas violem o regime disciplinar. A duração do intermento é, geralmente, de 1 a 3 anos, e de 3 a 5 anos para os crimes graves. Os internados deste Centro são submetidos ao treino diciplinar, actividade de aprendizagem, formação profissional e educação sob assistência.

As instalações do IM compreendem ainda: dormitórios, salas de educação, sala multifuncional, sala de actividade de grupo, etc. Existem ainda campos desportivos e zona de plantação a favor dos jovens internados.